GitHub MCP Serverがツール固有の構成設定（Tool-specific configuration）をサポートした。
新しい X-MCP-Tools ヘッダーで必要なツールだけを有効化し、コンテキストウィンドウの使用量を抑えられる。例えば filesystem_read_file のみを許可し、他を無効化する、といった制御ができる。
公式 Go SDK への移行に加え、セキュリティ向けに Lockdown mode が入った。プロンプトインジェクション対策のサニタイズや、パブリックリポジトリ向けの読み取り専用（書き込みツール無効化）が適用される。